efekt założyciela
jedną z możliwych przyczyn rozbieżności genetycznej jest efekt założyciela, który występuje, gdy kilka osób zostaje odizolowanych od pierwotnej populacji. Osoby te mogą przeceniać pewien wzór genetyczny, co oznacza, że pewne cechy biologiczne są przeceniane. Osoby te mogą tworzyć nową populację z różnymi pulami genów od pierwotnej populacji. Na przykład 10% pierwotnej populacji ma niebieskie oczy, a 90% ma brązowe. Przypadkowo od pierwotnej populacji oddzielono 10 osobników. Jeśli ta mała grupa ma 80% niebieskich oczu i 20% brązowych oczu, wtedy ich potomstwo byłoby bardziej prawdopodobne, aby mieć allel dla niebieskich oczu. W rezultacie odsetek populacji z niebieskimi oczami byłby wyższy niż populacja z brązowymi oczami, która różni się od pierwotnej populacji.
efekt wąskiego gardła
inną możliwą przyczyną różnic genetycznych jest efekt wąskiego gardła. Efekt wąskiego gardła występuje, gdy zdarzenie, takie jak klęska żywiołowa, powoduje śmierć dużej części populacji. Przez przypadek pewne wzorce genetyczne zostaną przecenione w pozostałej populacji, co jest podobne do tego, co dzieje się z efektem założyciela.

dywergencja genetyczna może wystąpić bez podziału geograficznego, poprzez destrukcyjną selekcję. Dzieje się tak, gdy osoby w populacji z wysokimi i niskimi skrajnościami fenotypowymi są sprawniejsze niż fenotyp pośredni. Osobniki te zajmują dwie różne nisze, w każdej niszy występuje podział cech Gaussa. Jeśli zmienność genetyczna między niszami jest wysoka, nastąpi silna izolacja reprodukcyjna. Jeśli zmienność genetyczna jest poniżej pewnego progu niż introgresja nastąpi, ale jeśli zmienność jest powyżej pewnego progu populacja może się podzielić w wyniku specjacji.
Dwa tryby specjalizują się w jedzeniu różnych rodzajów nasion małych i miękkich w porównaniu z dużymi i twardymi, co skutkuje dziobami o różnych rozmiarach i różnych zdolnościach siłowych. Osobniki o średnich rozmiarach dzioba są wybierane przeciw. Struktura utworu i reakcja na utwór również różnią się między tymi dwoma trybami. Pomiędzy dwoma trybami G. fortis występuje minimalny przepływ genów.